Variația fenotipică și loci ai trăsăturilor cantitative pentru rezistența la antracnoza sudică și la putregaiul trifoiului la trifoiul roșu

Trifoiul roșu (Trifolium pratense L.) este o leguminoasă furajeră importantă din regiunile temperate, apreciată în special pentru potențialul său ridicat de randament și pentru calitatea superioară a furajului. În ciuda progreselor substanțiale înregistrate în domeniul ameliorării în ultimele decenii, îmbunătățirea continuă a soiurilor este esențială pentru a asigura stabilitatea randamentului, având în vedere apariția unor noi boli sau schimbările condițiilor climatice. Diversitatea genetică ridicată prezentă în ecotipurile, soiurile locale și soiurile de trifoi roșu constituie o resursă neprețuită, dar adesea neexploatată, pentru îmbunătățirea unor trăsături cheie precum randamentul, calitatea și rezistența la stresul biotic și abiotic. O colecție de 397 de accesiuni de trifoi roșu a fost genotipată folosind o abordare de genotipare prin secvențiere în grup, cu 200 de plante per accesiune. Rezistența la cele două boli cele mai relevante în producția de trifoi roșu – antracnoza sudică cauzată de Colletotrichum trifolii și putregaiul trifoiului cauzat de Sclerotinia trifoliorum – a fost evaluată prin inoculare prin pulverizare. Rata medie de supraviețuire în cazul antracnozei sudice a fost de 22,9%, iar indicele mediu de rezistență la putregaiul trifoiului a fost de 34,0%. Analiza de asociere la nivel de genom a evidențiat mai multe loci asociate în mod semnificativ cu rezistența la antracnoza sudică și la putregaiul trifoiului. Majoritatea acestor loci se află în regiuni codificatoare. Un locus al trăsăturii cantitative (QTL) de pe cromozomul 1 a explicat 16,8% din variația rezistenței la antracnoza sudică. În ceea ce privește rezistența la putregaiul trifoiului, am identificat opt QTL, care explică împreună 80,2% din variația fenotipică totală. SNP-urile asociate cu aceste QTL constituie o resursă promițătoare pentru selecția asistată de markeri în programele de ameliorare existente, facilitând dezvoltarea de soiuri noi cu rezistență sporită împotriva a două boli fungice devastatoare ale trifoiului roșu.