Obliczanie rzeczywistej niezawodności przy użyciu regresji liniowej w ocenach genetycznych

W niniejszym dokumencie szczegółowo opisano zastosowanie regresji liniowej (LR) do oszacowania dokładności prognoz genomowych w hodowli zwierząt gospodarskich, w szczególności w ramach projektu SMARTER (grant UE „Horyzont 2020” nr 772787). Wyjaśniono w nim, w jaki sposób oblicza się rzeczywistą wiarygodność poprzez skorelowanie „starych” ocen genetycznych sporządzonych w momencie urodzenia z „najnowszymi” ocenami, gdy dostępne są dodatkowe dane (np. dane dotyczące potomstwa). Metoda ta pozwala określić ilościowo względny wzrost dokładności od urodzenia do osiągnięcia dojrzałości przy użyciu wzoru [1/r(w,p)] - 1, gdzie r(w,p) to korelacja między starymi a najnowszymi ocenami. Na przykład wartość r(w,p) wynosząca 0,8 oznacza 25-procentowy wzrost dokładności. Wysokie wartości r(w,p) sugerują wiarygodne wczesne prognozy; niskie wartości wskazują na niewiarygodność. Aby wyniki były miarodajne, wymagana jest co najmniej 50 zwierząt docelowych. Wyniki badań wspierają podejmowanie lepszych decyzji hodowlanych w przypadku małych przeżuwaczy.