Berekening van de fenotypische plasticiteit van wortels voor gewasveredeling

Dit document beschrijft een methode om de fenotypische plasticiteit van wortels te kwantificeren met behulp van de Relative Distance Plasticity Index (RDP1), waardoor veredelaars het aanpassingsvermogen van worteleigenschappen onder omgevingsstress kunnen beoordelen. Het geeft een gedetailleerde uitleg over de implementatie van RDP1 via R en RStudio, inclusief de benodigde pakketten: tidyverse, agricolae, psych, Plastcity en ggradar. De handleiding biedt stapsgewijze instructies voor het voorbereiden van gegevens met kolommen voor eigenschap, omgeving, genotype en eigenschapswaarde. De functie rdp1_matrix berekent paarsgewijze afstanden, en RDP1 wordt berekend als het gemiddelde van deze afstanden met standaardfout. De formule is afgeleid van relatieve afstanden tussen eigenschapswaarden. De resultaten worden opgeslagen in een dataframe en gevisualiseerd met behulp van spiderplots (ggradar) en puntdiagrammen om de plasticiteit tussen genotypen en eigenschappen te vergelijken. De methode ondersteunt veredelingsprogramma's die gericht zijn op veerkracht tegen droogte, hitte of voedingsstress, met toepassingen in zowel laboratorium- als veldomstandigheden.