Utveckling av en realtids-RT-PCR-metod för bredspektrumdetektion av Grapevine leafroll-associated virus-2 hos vinrankor

GLRaV-2, som tillhör släktet Closterovirus i familjen Closteroviridae, är en av de fem virusarter som är inblandade i vinstockarnas virala rullningssjukdom. Det består av sex molekylära varianter som uppvisar upp till 30 % nukleotidavvikelse. Utvecklingen av ett test för detektion av GLRaV-2 med realtids-RT-PCR krävde utformning av specifika och universella primärer för dessa olika varianter. Denna detektionsmetod har validerats på en internationell panel bestående av 85 vinramprover, varav 10 var negativa med ELISA-tekniken men positiva med den nya metoden. En 125-faldig ökning av känsligheten för realtids-RT-PCR jämfört med konventionell RT-PCR konstaterades, och dess tillämpning för detektion av GLRaV-2 i grundstammar visade dess överlägsenhet, särskilt på rotnivå.