En genotypanalyspanel med låg täckning för får av SMARTER-raser

En genotypningspanel med låg markörtäthet för får har tagits fram för SMARTER-raser i syfte att sänka genotypningskostnaderna samtidigt som man bibehåller hög informativitet i olika populationer. Panelen använder DNA-markörer från flera raser, däribland irländska och brittiska köttfår samt franska mjölkfår. Totalt 38 883 vanliga markörer användes för att skapa paneler med mellan 384 och 12 000 markörer genom att välja ut de mest informativa varianterna per genomblock. Panelen med 1 000 markörer är fortfarande informativ för alla raser, och panelen med 12 000 markörer innehåller 527 markörer som inte är informativa för minst en ras. Alla utvalda markörer är allmänt tillgängliga. Projektet finansieras av Europeiska unionens program Horisont 2020 enligt bidragsavtal nr 772787.