Rotplasticitet under kontrollerade vattenförhållanden: Metoder och uppställning

Rotplasticitet som svar på vattentillgång studeras med hjälp av röntgen-CT, WinRHIZO, transkriptomik och metabolomik under kontrollerade förhållanden. En metod som kombinerar flera tekniker möjliggör analys av rotsystemets 3D-arkitektur, kvantifiering av rotstorlek och diameter, profilering av genuttryck samt metabolisk fenotypning. Akrylglaskolonner (5–7 cm i diameter, 25 cm höga) fyllda med siktad jord och försedda med 30 µm-nät används, med kapillärbevattning och odling i klimatkammare (12 m³). CT-skanningar utförs under nattfasen för att undvika att störa fotosyntesen. Prover för transkriptomik och metabolomik samlas in under 24 timmar efter skanningen. Jordkolonnerna lindas in i aluminiumfolie för att begränsa ljusexponering och algtillväxt. Metoden är lämplig för mineraljordar och bygger på röntgen-CT, WinRHIZO och klimatkammare. Figur 1 visar majsrotens utveckling i sandjord under 21 dagar med en upplösning på 45 µm, med segmentering med Root2Res2 och visualisering i VcStudio Max.