Absolut qPCR-kvantifiering av arbuskulära mykorrhizasvampar i odlingsväxter

Ett validerat qPCR-protokoll för absolut kvantifiering av arbuskulära mykorrhizasvampar (AMF) i grödors rötter, vilket möjliggör tillförlitlig analys med hög genomströmning och minskad observatörsbias. Metoden använder specifika primrar (AMG1 och AM1), en standardkurva och optimerade cykelvillkor för noggrann uppskattning av genkopiantalet. Den är effektiv för vete och tomat, med praktiska steg för insamling av rötter, DNA-extraktion (DNeasy Plant Mini Kit) och qPCR-uppsättning i tre replikat. Resultaten var inte entydiga för purjolök, vilket tyder på att grödspecifik validering behövs. Kompletterar sekvensering för bedömning av mångfald.