genetski nadzor odpornosti proti južni antraknozi pri rdeči detelji

Vzorci rdeče detelje (Trifolium pratense L.) iz 28 držav so bili ocenjeni glede na odpornost proti južni antraknozi, ki jo povzroča Colletotrichum trifolii. Poskusi v rastlinjaku z inokulacijo posameznih spor so pokazali povprečno stopnjo preživetja 23 %, pri čemer je bilo le 10 vzorcev uvrščenih med odporne. Genotipizacija s sekvenciranjem je prinesla 30.668 SNP-jev, od katerih je bilo v analizi uporabljenih 12.272. BLUP-i in GWAS z metodo FarmCPU so identificirali več kot deset SNP-jev, ki so bili statistično pomembno povezani z odpornostjo. Analiza glavnih komponent je razkrila genetsko strukturo med vzorci. Ti rezultati podpirajo marker-podprto vzrejo za trajno odpornost, zlasti v okviru podnebnih sprememb. Podprto s projektom EU H2020 EUCLeg.