Končno poročilo POP3 Agricorder Friesland: Tehnično končno poročilo

V okviru tega projekta so bili razviti in validirani testi na osnovi metode LAMP za hitro odkrivanje *Pectobacterium carotovorum* subsp. *brasiliense* in *Pectobacterium parmentieri* v pridelkih krompirja. Nizi primerjev so bili zasnovani z uporabo analize BLAST, da se zagotovi specifičnost, pri čemer je učinkovitost odvisna od koncentracije DNK. Liza vzorcev v laboratoriju je povzročila razgradnjo DNK med prevozom, kar poudarja potrebo po lizi na kraju samem za ohranitev celovitosti vzorca. Pozitivne kontrole so potrdile delovanje testa, vendar so spremenljivi fluorescenčni signali nakazovali težave pri nizkih koncentracijah DNK ali občutljivosti primerjev. Za ohranjanje vzorcev je bil preizkušen FTA-papir, vendar so bili rezultati nejasni. Priporočila vključujejo optimizacijo naborov primerjev in razvoj zanesljivih protokolov lize na kraju samem za izboljšanje natančnosti odkrivanja na terenu.