Izračun fenotipske plastičnosti korenin za žlahtnjenje poljščin

Ta dokument predstavlja metodo za kvantificiranje fenotipske plastičnosti korenin z uporabo indeksa relativne razdalje plastičnosti (RDP1), ki vzrediteljem omogoča oceno prilagodljivosti lastnosti korenin v okoljskem stresu. Podrobno opisuje uporabo RDP1 v programih R in RStudio, vključno z zahtevanimi paketi – tidyverse, agricolae, psych, Plastcity in ggradar. Vodnik vsebuje podrobna navodila za pripravo podatkov s stolpci za lastnost, okolje, genotip in vrednost lastnosti. Funkcija rdp1_matrix izračuna razdalje med pari, RDP1 pa se izračuna kot povprečje teh razdalj s standardno napako. Formula izhaja iz relativnih razdalj med vrednostmi lastnosti. Rezultati so shranjeni v podatkovnem okviru in vizualizirani s pomočjo pajkovih grafikonov (ggradar) in točkovnih grafikonov za primerjavo plastičnosti med genotipi in lastnostmi. Metoda podpira programe vzreje, usmerjene v odpornost proti suši, vročini ali pomanjkanju hranil, z uporabo v laboratorijskih in poljskih pogojih.