Fenotypová variabilita a lokusy kvantitatívnych znakov pre odolnosť voči južnej antraknóze a hnilobe ďateliny u červenej ďateliny

Červená ďatelina (Trifolium pratense L.) je dôležitá krmovinová strukovina v miernych klimatických pásmach, ktorá je obzvlášť cenená pre svoj vysoký výnosový potenciál a vysokú kvalitu krmiva. Napriek značnému pokroku v šľachtení v priebehu posledných desaťročí je neustále zdokonaľovanie kultivarov kľúčové pre zabezpečenie stability výnosov s ohľadom na novo sa objavujúce choroby alebo meniace sa klimatické podmienky. Vysoká genetická diverzita prítomná v ekotypoch, miestnych odrodách a kultivaroch červeného ďateliny predstavuje neoceniteľný, avšak často nevyužitý zdroj pre zlepšovanie kľúčových vlastností, ako sú výnos, kvalita a odolnosť voči biotickým a abiotickým stresom. Zbierka 397 vzoriek červeného ďateliny bola genotypizovaná pomocou metódy zoskupeného genotypizovania sekvenovaním (genotyping-by-sequencing), pričom na jednu vzorku pripadalo 200 rastlín. Odolnosť voči dvom najrelevantnejším chorobám v pestovaní červenej ďateliny, južnej antraknóze spôsobenej Colletotrichum trifolii a hnilobe ďateliny spôsobenej Sclerotinia trifoliorum, bola hodnotená pomocou inokulácie postrekom. Priemerná miera prežitia pri južnej antraknóze bola 22,9 % a priemerný index odolnosti voči hnilobe ďateliny bol 34,0 %. Analýza asociácie v rámci celého genómu odhalila niekoľko lokusov, ktoré významne súvisia s odolnosťou voči južnej antraknóze a hnilobe ďateliny. Väčšina týchto lokusov sa nachádza v kódujúcich oblastiach. Jeden lokus kvantitatívneho znaku (QTL) na chromozóme 1 vysvetľoval 16,8 % variácie v odolnosti voči južnej antraknóze. V prípade odolnosti voči hnilobe ďateliny sme identifikovali osem QTL, ktoré spolu vysvetľujú 80,2 % celkovej fenotypovej variácie. SNP spojené s týmito QTL predstavujú sľubný zdroj pre selekciu podporovanú markermi v existujúcich šľachtiteľských programoch, čím uľahčujú vývoj nových kultivarov s vyššou odolnosťou voči dvom ničivým hubovým chorobám červenej ďateliny.