Mapa geografického rozloženia haplotypov CaLsol v Európe

„Candidatus Liberibacter solanacearum“ (Lso) bol zistený u viacerých dôležitých kultivovaných rastlín z čeľade Solanaceae (zemiak, paradajka, paprika a tabak) v Amerike a na Novom Zélande a z čeľade Apiaceae (mrkva, zeler, petržlen a paštrnák) v Európe. Fylogenetická analýza využívajúca kombináciu sekvencií génov 16S rRNA, intergenovej spacerovej oblasti (ISR) 16S-23S rRNA a 50S ribozomálneho proteínu odhalila, že baktérie Lso nájdené v rôznych geografických regiónoch boli rôznorodé a mohli byť zaradené do piatich samostatných kladov: haplotyp A, B, C, D alebo E (Nelson et al., 2011; Teresani et al., 2014). Haplotypy Lso A a B, spojené s ochorením zemiakov nazývaným „zebra chip“ (Secor et al., 2009) a prenášané psyllidom Bactericera cockerelli, sa v Európe nevyskytujú. Naopak, haplotyp Lso C (LsoC) je spojený s ochorením mrkvy na zožltnutie v severnej Európe, kde ho prenáša mrkvička Trioza apicalis, čo spôsobuje vážne straty úrody mrkvy v dôsledku spolupríčiniek bakteriálnych infekcií a poškodenia spôsobeného žraním mrkvičiek (Munyaneza et al., 2010; Munyaneza et al., 2011; Nissinen et al., 2014). Hlásilo sa tiež, že LsoC infikuje mrkvu vo Švédsku, Nórsku a Nemecku (Munyaneza et al., 2010, Munyaneza et al., 2012a; Munyaneza et al., 2012b). V južnej Európe bolo hlásené, že haplotypy Lso D a E (LsoD a LsoE, v uvedenom poradí) infikujú mrkvu, zeler, pastinák a petržlen a sú prenášané psyllidom Bactericera trigonica (Alfaro-Fernandez et al., 2012; Nelson et al., 2013; Teresani et al., 2014; Alfaro-Fernandez et al., 2017; Antolinez et al., 2017). Hoci bol Lso zistený vo Francúzsku, charakterizácia haplotypov a ich distribúcia stále nie sú stanovené. Hlavným cieľom tejto štúdie, vypracovanej v rámci úlohy 3b projektu, bolo preto zlepšiť poznatky o distribúcii haplotypov Lso v Európe.