Alcuni esempi dei vantaggi e dei limiti della selezione assistita da marcatori nella patata

La selezione assistita da marcatori (SAM) è possibile solo se i marcatori molecolari sono facilmente utilizzabili e informativi. Nel caso della patata, specie tetraploide ed eterozigote, la SAM è ancora piuttosto poco sviluppata al momento. Il nostro approccio è stato, da un lato, quello di ricercare marcatori molecolari legati a caratteri di interesse a partire da popolazioni diploidi in segregazione e di testarne la trasferibilità a livello tetraploide e, dall’altro, di testare marcatori molecolari già pubblicati in diversi pool genetici tetraploidi. I modelli selezionati erano la resistenza ai parassiti (la peronospora fogliare causata da Phytophthora infestans, la resistenza ai nematodi a cisti Globodera rostochiensis e G. pallida, la resistenza al virus Y) e il contenuto di glicoalcaloidi nei tuberi. Nel caso di un determinismo genetico semplice (come nel caso del gene Ry che conferisce resistenza al virus Y proveniente da Solanum stoloniferum o del gene R1 di resistenza alla peronospora proveniente da S. demissum), i marcatori pubblicati sono stati convalidati in diversi pool genetici. Per il gene H1 che conferisce resistenza a G. rostochiensis, il marcatore disponibile al momento del progetto si è rivelato non correlato alla resistenza nel nostro materiale, ma da allora sono stati convalidati altri marcatori. Nel caso di una resistenza oligogenica, illustrata dalla resistenza a G. pallida, il cui determinismo genetico è controllato da 2 QTL, è stata testata la trasferibilità di 4 marcatori che consentono di tracciare il QTL ad effetto forte GpaVspl in diversi pool genetici tetraploidi. Sono stati inoltre convalidati due marcatori che consentono di monitorare il QTL a effetto debole GpaXIspl. L’insieme dei marcatori è stato trasferito ai partner professionali, che ora li utilizzano su diverse scale nei loro programmi di selezione. Per i caratteri a determinazione poligenica (resistenza alla peronospora fogliare e tenore di glicoalcaloidi), sembra attualmente prematuro prendere in considerazione la SAM.