Calcolo della plasticità fenotipica delle radici per il miglioramento genetico delle colture

Il presente documento illustra un metodo per quantificare la plasticità fenotipica delle radici utilizzando l'indice di plasticità della distanza relativa (RDP1), consentendo agli allevatori di valutare l'adattabilità dei tratti radicali in condizioni di stress ambientale. Descrive in dettaglio l'implementazione dell'RDP1 tramite R e RStudio, compresi i pacchetti necessari: tidyverse, agricolae, psych, Plastcity e ggradar. La guida fornisce istruzioni dettagliate per la preparazione dei dati con colonne dedicate a caratteristica, ambiente, genotipo e valore della caratteristica. La funzione rdp1_matrix calcola le distanze a coppie e l'RDP1 viene calcolato come media di queste distanze con errore standard. La formula deriva dalle distanze relative tra i valori delle caratteristiche. I risultati vengono memorizzati in un data frame e visualizzati utilizzando grafici a ragnatela (ggradar) e grafici a punti per confrontare la plasticità tra genotipi e tratti. Il metodo supporta programmi di selezione mirati alla resilienza alla siccità, al calore o allo stress nutrizionale, con applicazioni sia in laboratorio che in campo.