Quantificazione assoluta mediante qPCR dei funghi delle micorrize arbuscolari nelle piante coltivate

Un protocollo qPCR convalidato per la quantificazione assoluta dei funghi micorrizici arbuscolari (AMF) nelle radici delle colture, che consente un'analisi affidabile e ad alta produttività con una riduzione del bias dell'osservatore. Il metodo utilizza primer specifici (AMG1 e AM1), una curva standard e condizioni di ciclo ottimizzate per una stima accurata del numero di copie geniche. È efficace per il grano e il pomodoro, con procedure pratiche per la raccolta delle radici, l'estrazione del DNA (DNeasy Plant Mini Kit) e l'impostazione della qPCR in triplicato. I risultati non sono stati conclusivi nel caso del porro, suggerendo la necessità di una validazione specifica per coltura. Complementare al sequenziamento per la valutazione della diversità.