DINeR: banca dati per la ricerca sui neuropeptidi degli insetti

I neuropeptidi sono responsabili della regolazione di una serie di funzioni, tra cui lo sviluppo, il metabolismo, l'omeostasi idrica e ionica, e agiscono come neuromodulatori nei circuiti del sistema nervoso centrale. Sono stati identificati e caratterizzati numerosi neuropeptidi. Tuttavia, sia la scoperta che la caratterizzazione funzionale dei neuropeptidi nell'ampia classe degli Insetti è stata sporadica. Per sfruttare i progressi delle tecnologie post-genomiche in questo campo in rapida crescita, la neuroendocrinologia degli insetti richiede una risorsa consolidata, completa e standardizzata per la gestione delle informazioni sui neuropeptidi. Il Database for Insect Neuropeptide Research (DINeR) è un'applicazione database basata sul web utilizzata per la ricerca e il recupero di informazioni sui neuropeptidi di varie specie di insetti, che descrive in dettaglio le sequenze delle loro isoforme, la funzionalità fisiologica e le immagini dei loro siti di legame con i recettori, in un formato intuitivo, accessibile e di facile utilizzo. I dati curati includono rappresentanti di 50 famiglie di neuropeptidi ben descritte provenienti da oltre 400 diverse specie di insetti. Sono state registrate circa 4700 sequenze aminoacidiche di isoforme di neuropeptidi in formato FASTA e oltre 200 record di funzionalità fisiologica sulla base della letteratura pubblicata. Sono inoltre disponibili immagini delle posizioni dei recettori dei neuropeptidi. Inoltre, i dati includono sintesi complete per ciascuna famiglia di neuropeptidi, comprese la loro funzione, la localizzazione, la funzionalità nota, nonché cladogrammi, allineamenti di sequenze e logogrammi che coprono la maggior parte degli ordini di insetti. Inoltre, abbiamo adottato una nomenclatura standardizzata per risolvere le incongruenze nella classificazione dei neuropeptidi.