Néhány példa a burgonya markerekkel támogatott szelekciójának előnyeire és korlátaira

A markerekkel támogatott szelekció (SAM) csak akkor lehetséges, ha a molekuláris markerek könnyen használhatók és informatívak. A burgonya esetében – amely egy tetraploid és heterozigóta faj – a SAM jelenleg még viszonylag kevéssé fejlett. Megközelítésünk egyrészt abból állt, hogy szegregáló diploid populációkból kerestünk a vizsgált tulajdonságokhoz kapcsolódó molekuláris markereket, és teszteltük azok átvihetőségét a tetraploid szintre, másrészt pedig a már publikált molekuláris markerek tesztelése különböző tetraploid génállományokban. A kiválasztott modellek a kártevőkkel szembeni ellenállás (a Phytophthora infestans által okozott lombpenész, a Globodera rostochiensis és G. pallida cisztás fonálférgekkel szembeni ellenállás, valamint a Y-vírussal szembeni ellenállás) és a gumók glikoalkaloid-tartalma voltak. Egyszerű genetikai determinizmus esetén (például a Solanum stoloniferumból származó, a Y-vírus elleni rezisztenciát biztosító Ry gén vagy a S. demissumból származó, a levélpenész elleni rezisztenciát biztosító R1 gén esetében) a publikált markerek különböző génállományokban validálhatók voltak. A G. rostochiensis elleni rezisztenciát biztosító H1 gén esetében a projekt idején rendelkezésre álló marker a mi anyagunkban nem bizonyult a rezisztenciához kapcsolódónak, de azóta más markereket validáltak. Oligogén rezisztencia esetén – amelyet a G. pallida elleni rezisztencia példáz, amelynek genetikai meghatározottságát 2 QTL szabályozza – 4 olyan marker hordozhatóságát tesztelték, amelyek lehetővé teszik az erős hatású GpaVspl QTL nyomon követését különböző tetraploid génállományokban. Két olyan markert is validáltak, amelyekkel a gyenge hatású GpaXIspl QTL nyomon követhető. Az összes markert átadták a szakmai partnereknek, akik mostantól különböző mértékben használják azokat szelekciós programjaikban. A poligénes meghatározottságú tulajdonságok (lombpenész-rezisztencia és glikoalkaloid-tartalom) esetében jelenleg még korainak tűnik a SAM alkalmazásának fontolgatása.