A gyökér fenotípusos plaszticitásának kiszámítása a növénynemesítésben

Ez a dokumentum bemutatja a gyökér fenotípusos plaszticitásának a relatív távolság-plaszticitási index (RDP1) segítségével történő számszerűsítésére szolgáló módszert, amely lehetővé teszi a tenyésztők számára, hogy környezeti stressz hatására értékeljék a gyökér tulajdonságainak alkalmazkodóképességét. Részletesen leírja az RDP1 R és RStudio segítségével történő megvalósítását, beleértve a szükséges csomagokat: tidyverse, agricolae, psych, Plastcity és ggradar. Az útmutató lépésről lépésre ismerteti az adatok előkészítését, a tulajdonságok, a környezet, a genotípus és a tulajdonságértékek oszlopokkal. Az rdp1_matrix függvény kiszámítja a páronkénti távolságokat, és az RDP1-et ezeknek a távolságoknak a standard hibával kiszámított átlagaként határozza meg. A képlet a tulajdonságértékek közötti relatív távolságokból származik. Az eredményeket egy adatkockában tárolják, és pókdiagramokkal (ggradar) és pontdiagramokkal ábrázolják, hogy összehasonlítsák a genotípusok és a tulajdonságok közötti plaszticitást. A módszer támogatja a szárazság, a hő vagy a tápanyaghiány okozta stresszzel szembeni ellenálló képességet célzó tenyésztési programokat, és laboratóriumi és terepi körülmények között egyaránt alkalmazható.