A gyökérgombák abszolút qPCR-alapú mennyiségi meghatározása haszonnövényekben

Egy validált qPCR-eljárás az arbuszkuláris mikorrhiza gombák (AMF) abszolút mennyiségének meghatározására növényi gyökerekben, amely nagy áteresztőképességű, megbízható elemzést tesz lehetővé a megfigyelői torzítás csökkentése mellett. A módszer specifikus primereket (AMG1 és AM1), standard görbét és optimalizált ciklusfeltételeket használ a génmásolatok számának pontos becsléséhez. Hatékonyan alkalmazható búzán és paradicsomon, gyakorlati lépésekkel a gyökérgyűjtéshez, a DNS-kivonáshoz (DNeasy Plant Mini Kit) és a qPCR beállításához három párhuzamos mintán. A póréhagymánál az eredmények nem voltak egyértelműek, ami arra utal, hogy növényfaj-specifikus validációra van szükség. Kiegészíti a szekvenálást a diverzitás értékelésében.