Contrôle génétique de la résistance à l'anthracnose méridionale chez le trèfle rouge

Des accessions de trèfle rouge (Trifolium pratense L.) provenant de 28 pays ont été évaluées quant à leur résistance à l'anthracnose du sud causée par Colletotrichum trifolii. Des essais en serre avec inoculation à spore unique ont montré un taux de survie moyen de 23 %, seules 10 accessions ayant été classées comme résistantes. Le génotypage par séquençage a permis d’identifier 30 668 SNP, dont 12 272 ont été utilisés dans l’analyse. Les BLUP et l’analyse GWAS FarmCPU ont permis d’identifier plus de dix SNP significativement associés à la résistance. L’analyse en composantes principales a mis en évidence la structure génétique entre les accessions. Ces résultats plaident en faveur d’une sélection assistée par marqueurs visant à obtenir une résistance durable, en particulier dans le contexte du changement climatique. Projet soutenu par le programme H2020 de l’UE « EUCLeg ».