Punase ristikheina fenotüübiline variatsioon ja kvantitatiivsete tunnuste lokused vastupidavuse suhtes lõunapoolsele antraknoosile ja ristikheina mädanikule

Punane ristik (Trifolium pratense L.) on mõõdukate kliimavööndite oluline söödakultuur, mida hinnatakse eelkõige selle suure saagipotentsiaali ja kõrge söödakvaliteedi poolest. Vaatamata viimaste aastakümnete märkimisväärsetele edusammudele aretuses on sortide pidev täiustamine ülioluline saagikuse stabiilsuse tagamiseks, arvestades uusi tekkivaid haigusi ja muutuvaid kliimatingimusi. Punase ristikuga seotud ökotüüpide, maaharimissortide ja kultivaride suur geneetiline mitmekesisus pakub hindamatut, kuid sageli kasutamata ressurssi selliste võtmetähtsusega omaduste parandamiseks nagu saagikus, kvaliteet ning vastupidavus bioloogilistele ja abiootilistele stressifaktoritele. 397 punase ristikuga seotud proovi genotüüpiti, kasutades koondatud genotüpiseerimist sekveneerimise abil, kus iga proovi kohta võeti 200 taime. Vastupidavust kahele punase ristikuviljeluses kõige olulisemale haigusele – lõunapoolsele antraknoosile, mille põhjustab Colletotrichum trifolii, ja ristikumädanikule, mille põhjustab Sclerotinia trifoliorum – hinnati pihustamisinokulatsiooni abil. Lõuna-antraknoosi keskmine ellujäämismäär oli 22,9% ja ristikumädaniku keskmine resistentsusindeks 34,0%. Genoomiülene assotsiatsioonianalüüs tuvastas mitu lokust, mis olid oluliselt seotud vastupidavusega lõuna-antraknoosile ja ristikumädanikule. Enamik neist lokustest asub kodeerivates piirkondades. Üks kvantitatiivse tunnuse lokus (QTL) 1. kromosoomil seletas 16,8% lõunapoolse antraknoosi resistentsuse variatsioonist. Ristikumädaniku resistentsuse puhul leidsime kaheksa QTL-i, mis seletasid kokku 80,2% kogu fenotüübilisest variatsioonist. Nende QTL-idega seotud SNP-d pakuvad paljutõotavat ressurssi markerite abil toimuva selektsiooni jaoks olemasolevates aretusprogrammides, hõlbustades uute sordite arendamist, millel on suurem resistentsus punase ristikuga seotud kahe laastava seenhaiguse vastu.