Geneetilistes hindamistes realiseeritud usaldusväärsuse arvutamine lineaarset regressiooni kasutades

Käesolevas dokumendis kirjeldatakse lineaarset regressiooni (LR) kasutamist loomade genoomiprognooside täpsuse hindamiseks, eelkõige SMARTER-projekti raames (ELi Horisont 2020 toetus 772787). Selles selgitatakse, kuidas arvutatakse tegelikku usaldusväärsust, korreleerides sünnihetkel tehtud „vanu“ geneetilisi hinnanguid „viimaste“ hinnangutega, mis on saadud pärast täiendavate andmete (nt järglaste andmed) kättesaadavaks muutumist. Meetod kvantifitseerib täpsuse suhtelist suurenemist sünnist täiskasvanueani, kasutades valemit [1/r(w,p)] - 1, kus r(w,p) on korrelatsioon vanade ja hiljutiste tõendite vahel. Näiteks r(w,p) väärtus 0,8 näitab täpsuse 25% suurenemist. Kõrged r(w,p) väärtused viitavad usaldusväärsetele varastele prognoosidele; madalad väärtused viitavad ebausaldusväärsusele. Kehtivate tulemuste saamiseks on vaja vähemalt 50 fokaalset looma. Tulemused toetavad väikemäletsejaliste aretamisotsuste parandamist.