Ein Genotyp-Panel mit geringer Genomabdeckung für SMARTER-Rassen

Für SMARTER-Rassen wurde ein Genotyp-Panel mit geringer Markerdichte entwickelt, um die Genotypisierungskosten zu senken und gleichzeitig eine hohe Aussagekraft über verschiedene Populationen hinweg zu gewährleisten. Das Panel nutzt DNA-Marker aus mehreren Rassen, darunter irische und britische Fleischschafe sowie französische Milchschafe. Insgesamt wurden 38.883 gemeinsame Marker verwendet, um Panels mit 384 bis 12.000 Markern zu erstellen, wobei pro Genomblock die aussagekräftigsten Varianten ausgewählt wurden. Das Panel mit 1.000 Markern bleibt über alle Rassen hinweg informativ, während das Panel mit 12.000 Markern 527 Marker enthält, die bei mindestens einer Rasse nicht informativ sind. Alle ausgewählten Marker sind öffentlich zugänglich. Das Projekt wird durch das Programm „Horizont 2020“ der Europäischen Union im Rahmen der Fördervereinbarung Nr. 772787 finanziert.