Berechnung der phänotypischen Plastizität von Wurzeln für die Pflanzenzüchtung

Dieses Dokument stellt eine Methode zur Quantifizierung der phänotypischen Plastizität von Wurzeln unter Verwendung des Relative Distance Plasticity Index (RDP1) vor, die es Züchtern ermöglicht, die Anpassungsfähigkeit von Wurzelmerkmalen unter Umweltbelastungen zu bewerten. Es beschreibt detailliert die Umsetzung von RDP1 mit R und RStudio, einschließlich der erforderlichen Pakete – tidyverse, agricolae, psych, Plastcity und ggradar. Der Leitfaden enthält Schritt-für-Schritt-Anleitungen zur Datenaufbereitung mit Spalten für Merkmal, Umwelt, Genotyp und Merkmalswert. Die Funktion rdp1_matrix berechnet paarweise Abstände, und der RDP1 wird als Mittelwert dieser Abstände mit Standardfehler berechnet. Die Formel leitet sich aus den relativen Abständen zwischen den Merkmalswerten ab. Die Ergebnisse werden in einem Datenrahmen gespeichert und mithilfe von Spinnen-Diagrammen (ggradar) und Punktdiagrammen visualisiert, um die Plastizität über Genotypen und Merkmale hinweg zu vergleichen. Die Methode unterstützt Züchtungsprogramme, die auf Resistenz gegen Trockenheit, Hitze oder Nährstoffmangel abzielen, mit Anwendungen sowohl unter Labor- als auch unter Feldbedingungen.