Absolute qPCR-Quantifizierung von Arbuskulären Mykorrhizapilzen in Kulturpflanzen

Ein validiertes qPCR-Protokoll zur absoluten Quantifizierung von arbuskulären Mykorrhizapilzen (AMF) in Pflanzenwurzeln, das eine zuverlässige Hochdurchsatzanalyse mit reduzierter Beobachterverzerrung ermöglicht. Die Methode nutzt spezifische Primer (AMG1 und AM1), eine Standardkurve und optimierte Zyklusbedingungen für eine genaue Schätzung der Genkopienzahl. Sie ist für Weizen und Tomaten wirksam und umfasst praktische Schritte zur Wurzelsammlung, DNA-Extraktion (DNeasy Plant Mini Kit) und qPCR-Durchführung in dreifacher Ausfertigung. Bei Lauch waren die Ergebnisse nicht eindeutig, was darauf hindeutet, dass eine kulturspezifische Validierung erforderlich ist. Ergänzend zur Sequenzierung zur Diversitätsbewertung.