DINeR: Datenbank für die Forschung an Neuropeptiden bei Insekten

Neuropeptide sind für die Regulierung einer Vielzahl von Funktionen verantwortlich, darunter Entwicklung, Stoffwechsel, Wasser- und Ionenhomöostase sowie als Neuromodulatoren in Schaltkreisen des Zentralnervensystems. Zahlreiche Neuropeptide wurden bereits identifiziert und charakterisiert. Allerdings erfolgten sowohl die Entdeckung als auch die funktionelle Charakterisierung von Neuropeptiden in der riesigen Klasse der Insekten bislang nur sporadisch. Um die Fortschritte in den postgenomischen Technologien für dieses schnell wachsende Forschungsgebiet zu nutzen, benötigt die Insektenneuroendokrinologie eine konsolidierte, umfassende und standardisierte Ressource zur Verwaltung von Neuropeptid-Informationen. Die Database for Insect Neuropeptide Research (DINeR) ist eine webbasierte Datenbankanwendung, die zur Suche und Abfrage von Neuropeptid-Informationen verschiedener Insektenarten dient und deren Isoformsequenzen, physiologische Funktionen sowie Bilder ihrer Rezeptorbindungsstellen in einem intuitiven, zugänglichen und benutzerfreundlichen Format detailliert darstellt. Die kuratierten Daten umfassen Vertreter von 50 gut beschriebenen Neuropeptidfamilien aus über 400 verschiedenen Insektenarten. Basierend auf veröffentlichter Literatur wurden etwa 4700 im FASTA-Format vorliegende Aminosäuresequenzen von Neuropeptid-Isoformen und über 200 Datensätze zur physiologischen Funktionalität erfasst. Ebenfalls verfügbar sind Bilder der Neuropeptid-Rezeptorlokalisierungen. Darüber hinaus enthalten die Daten umfassende Zusammenfassungen für jede Neuropeptidfamilie, einschließlich ihrer Funktion, Lokalisation und bekannten Funktionalität, sowie Kladogramme, Sequenzalignments und Logos, die die meisten Insektenordnungen abdecken. Außerdem haben wir eine standardisierte Nomenklatur eingeführt, um der uneinheitlichen Klassifizierung von Neuropeptiden entgegenzuwirken.