Nogle eksempler på fordele og begrænsninger ved markørassisteret selektion hos kartoflen

Markørassisteret selektion (SAM) er kun mulig, hvis de molekylære markører er let anvendelige og informative. Hos kartoflen, som er en tetraploid og heterozygot art, er SAM foreløbig endnu ikke særlig udbredt. Vores tilgang har på den ene side været at søge efter molekylære markører, der er knyttet til karaktertræk af interesse, ud fra diploide populationer i segregering og at teste deres overførbarhed til det tetraploide niveau, og på den anden side at teste allerede offentliggjorte molekylære markører i forskellige tetraploide genbanker. De udvalgte modeller var resistens over for skadedyr (bladskimmel forårsaget af Phytophthora infestans, resistens over for cystenematoder Globodera rostochiensis og G. pallida samt resistens over for Y-virus) og indholdet af glycoalkaloider i knoldene. I tilfælde af enkel genetisk determinisme (som det er tilfældet med Ry-genet, der giver resistens mod Y-virus fra Solanum stoloniferum, eller R1-genet for resistens mod bladskimmel fra S. demissum) kunne de offentliggjorte markører valideres i forskellige genpuljer. For H1-genet, der giver resistens mod G. rostochiensis, viste den markør, der var tilgængelig på projektets tidspunkt, sig ikke at være knyttet til resistensen i vores materiale, men andre markører er siden blevet valideret. I tilfælde af oligogen resistens, som illustreret ved resistensen mod G. pallida, hvor den genetiske determinisme styres af to QTL’er, blev overførbarheden af fire markører, der gør det muligt at spore QTL’en med stærk effekt, GpaVspl, i forskellige tetraploide genpuljer testet. To markører, der gør det muligt at spore QTL’en med svag effekt, GpaXIspl, er ligeledes blevet valideret. Samtlige markører er blevet overført til de professionelle partnere, som nu anvender dem i forskelligt omfang i deres avlsprogrammer. For de polygenisk bestemte egenskaber (resistens mod bladskimmel og indhold af glycoalkaloider) forekommer det på nuværende tidspunkt for tidligt at overveje SAM.