Fænotypisk variation og kvantitative genlokaler for resistens mod sydlig antraknose og kløverrådne hos rødkløver

Rødkløver (Trifolium pratense L.) er en vigtig foderbælgplante i tempererede områder, der især værdsættes for sit høje udbyttepotentiale og sin høje foder kvalitet. På trods af betydelige fremskridt inden for forædling i de seneste årtier er en løbende forbedring af sorterne afgørende for at sikre udbytestabilitet i lyset af nye sygdomme eller skiftende klimatiske forhold. Den store genetiske diversitet, der findes i rødkløverets økotyper, landracer og sorter, udgør en uvurderlig, men ofte uudnyttet ressource til forbedring af nøgleegenskaber såsom udbytte, kvalitet og modstandsdygtighed over for biotisk og abiotisk stress. En samling på 397 rødkløver-accessioner blev genotypet ved hjælp af en samlet genotypebestemmelse via sekventering med 200 planter pr. accession. Modstandsdygtigheden over for de to mest relevante sygdomme i rødkløverproduktionen – sydlig antraknose forårsaget af Colletotrichum trifolii og kløverrådne forårsaget af Sclerotinia trifoliorum – blev vurderet ved hjælp af sprøjteinokulering. Den gennemsnitlige overlevelsesrate for sydlig antraknose var 22,9 %, og det gennemsnitlige resistensindeks for kløverråd var 34,0 %. En genomomfattende associeringsanalyse afslørede flere loci, der var signifikant forbundet med resistens over for sydlig antraknose og kløverråd. De fleste af disse loci befinder sig i kodende regioner. Et kvantitativt træk-lokus (QTL) på kromosom 1 forklarede 16,8 % af variationen i resistens mod sydlig antraknose. For resistens mod kløverråd fandt vi otte QTL, der tilsammen forklarede 80,2 % af den samlede fænotypiske variation. De SNP'er, der er forbundet med disse QTL, udgør en lovende ressource til markørassisteret selektion i eksisterende avlsprogrammer, hvilket letter udviklingen af nye sorter med øget resistens mod to ødelæggende svampesygdomme hos rødkløver.