Absolut qPCR-kvantificering af arbuskulære mykorrhizasvampe i afgrødeplanter

En valideret qPCR-protokol til absolut kvantificering af arbuskulære mykorrhizasvampe (AMF) i afgrøderødder, der muliggør pålidelig analyse med høj gennemstrømning og reduceret observatørbias. Metoden anvender specifikke primere (AMG1 og AM1), en standardkurve og optimerede cyklusbetingelser til nøjagtig estimering af genkopital. Den er effektiv for hvede og tomat, med praktiske trin til rodindsamling, DNA-ekstraktion (DNeasy Plant Mini Kit) og qPCR-opsætning i tre replikater. Resultaterne var ikke entydige for porrer, hvilket tyder på, at der er behov for afgrødespecifik validering. Et supplement til sekventering til vurdering af diversitet.