Genotypebestemmelse af 1.444 traditionelle tomatsorter i TRADITOM-projektet

TRADITOM-projektet genotypede 1.444 traditionelle tomatsorter fra Spanien, Frankrig, Italien, Grækenland og Israel, hvilket oversteg det oprindelige mål på 1.200. Ved hjælp af SNP-analyse blev der identificeret 179.000 varianter af høj kvalitet blandt i alt 39 millioner SNP'er. DNA-kvalitetskontrol sikrede, at 1.194 prøver bestod de indledende kontroller, og yderligere prøver blev tilføjet for at nå op på 1.444 succesfuldt genotypede accessioner. Hovedkomponentanalyse afslørede klare genetiske forskelle mellem sorterne. Datasættet viser stor genetisk variation og understøtter udviklingen af en kernesamling til biokemisk analyse i WP3. Genotypningsprocessen viste sig at være robust, og resultaterne er egnede til sortautentificering og beskyttelse af traditionelle produkter.