Reāllaika RT-PCR metodes izstrāde vīnogulāju lapu saritināšanās vīrusa-2 (Grapevine leafroll-associated virus-2) plaša spektra noteikšanai vīnogulājos

GLRaV-2, kas pieder pie Closterovirus ģints Closteroviridae dzimtā, ir viena no piecām vīrusu sugām, kas saistītas ar vīnogulāju vīrusu savīšanās slimību. Tas sastāv no 6 molekulāriem variantiem, kuru nukleotīdu atšķirības sasniedz līdz pat 30 %. Lai izstrādātu GLRaV-2 noteikšanas testu, izmantojot reāllaika RT-PCR, bija nepieciešams izstrādāt specifiskus un universālus primerus, kas būtu piemēroti šiem dažādajiem variantiem. Šī noteikšanas metode tika validēta, izmantojot starptautisku 85 vīnogulāju paraugu kopu, no kuriem 10 paraugi bija negatīvi, izmantojot ELISA metodi, bet pozitīvi, izmantojot šo jauno metodi. Tika konstatēts, ka reāllaika RT-PCR jutība ir 125 reizes lielāka nekā klasiskajai RT-PCR, un tās pielietošana GLRaV-2 noteikšanai potcelmos parādīja tās pārākumu, jo īpaši sakņu līmenī.