Fenotipiskās variācijas un kvantitatīvo pazīmju lokusi, kas nosaka sarkanā āboliņa izturību pret dienvidu antraknozi un āboliņa puvi

Sarkanais āboliņš (Trifolium pratense L.) ir nozīmīgs lopbarības pākšaugs mērenā klimata reģionos, ko īpaši novērtē tā augstā ražības potenciāla un augstās lopbarības kvalitātes dēļ. Neskatoties uz ievērojamo selekcijas progresu pēdējo desmitgažu laikā, šķirņu nepārtraukta uzlabošana ir būtiska, lai nodrošinātu ražas stabilitāti, ņemot vērā jaunas slimības vai mainīgos klimatiskos apstākļus. Lielā ģenētiskā daudzveidība, kas raksturīga sarkanā āboliņa ekotipiem, vietējām šķirnēm un kultivāriem, ir nenovērtējams, taču bieži neizmantots resurss tādu galveno pazīmju uzlabošanai kā ražība, kvalitāte un izturība pret biotisko un abiotisko stresu. 397 sarkano āboliņu paraugu kolekcijai tika veikta genotipizācija, izmantojot apvienoto genotipizāciju ar sekvencēšanu, ņemot vērā 200 augus no katra parauga. Izturību pret divām sarkanā āboliņa audzēšanā visbūtiskākajām slimībām — dienvidu antraknozi, ko izraisa Colletotrichum trifolii, un āboliņa puvi, ko izraisa Sclerotinia trifoliorum — novērtēja, izmantojot inokulāciju ar izsmidzināšanu. Vidējais izdzīvošanas rādītājs attiecībā uz dienvidu antraknozi bija 22,9 %, bet vidējais izturības indekss attiecībā uz āboliņa puvi — 34,0 %. Genomā plaša asociācijas analīze atklāja vairākus lokusus, kas ir nozīmīgi saistīti ar izturību pret dienvidu antraknozi un āboliņa puvi. Lielākā daļa no šiem lokusiem atrodas kodējošajos reģionos. Viens kvantitatīvās pazīmes lokuss (QTL) 1. hromosomā izskaidroja 16,8 % no rezistences pret dienvidu antraknozi variācijas. Attiecībā uz izturību pret āboliņa puvi mēs atklājām astoņus QTL, kas kopā izskaidroja 80,2 % no kopējās fenotipiskās variācijas. Ar šiem QTL saistītie SNP nodrošina daudzsološu resursu marķieru palīdzībai selekcijā esošajās selekcijas programmās, veicinot jaunu šķirņu attīstību ar paaugstinātu izturību pret divām postošām sarkanā āboliņa sēnīšu slimībām.