Ģenētiskajās novērtējumos aprēķināt faktisko uzticamību, izmantojot lineāro regresiju

Šajā dokumentā ir sīki izklāstīta lineārās regresijas (LR) izmantošana, lai novērtētu genomisko prognožu precizitāti mājlopu audzēšanā, konkrēti SMARTER projektā (ES programma „Apvārsnis 2020“, grants Nr. 772787). Tajā ir izskaidrots, kā aprēķina faktisko uzticamību, korelējot „vecās“ ģenētiskās novērtējumus dzimšanas brīdī ar „jaunākajiem“ novērtējumiem pēc tam, kad kļūst pieejami papildu dati (piemēram, pēcnācēju dati). Metode kvantificē relatīvo precizitātes pieaugumu no dzimšanas līdz briedumam, izmantojot formulu [1/r(w,p)] - 1, kur r(w,p) ir korelācija starp vecajiem un jaunākajiem novērtējumiem. Piemēram, r(w,p) vērtība 0,8 norāda uz 25 % precizitātes pieaugumu. Augstas r(w,p) vērtības liecina par uzticamām agrīnām prognozēm; zemas vērtības norāda uz neuzticamību. Lai rezultāti būtu derīgi, ir nepieciešami vismaz 50 fokusa dzīvnieki. Rezultāti atbalsta uzlabotus selekcijas lēmumus attiecībā uz mazajiem atgremotājiem.