Realaus laiko RT-PCR metodo, skirto plačios spektro Grapevine leafroll-associated virus-2 nustatymui vynmedžiuose, sukūrimas

GLRaV-2, priklausantis Closterovirus genčiai iš Closteroviridae šeimos, yra viena iš 5 virusų rūšių, susijusių su vynmedžių virusine susirangymo liga. Jį sudaro 6 molekuliniai variantai, kurių nukleotidų skirtumai siekia iki 30 %. Norint sukurti GLRaV-2 nustatymo testą, atliekamą realaus laiko RT-PCR metodu, reikėjo sukurti specifinius ir universalius pradmenis, tinkamus šiems skirtingiems variantams. Šis nustatymo metodas buvo patvirtintas tarptautinėje 85 vynmedžių mėginių grupėje, iš kurių 10 buvo neigiami taikant ELISA metodą, bet teigiami pagal šį naują metodą. Nustatyta, kad realaus laiko RT-PCR jautrumas, palyginti su tradicine RT-PCR, padidėjo 125 kartus, o jo taikymas GLRaV-2 nustatymui poskiepiuose parodė jo pranašumą, ypač šaknų lygmenyje.