Raudonojo dobilų fenotipiniai skirtumai ir kiekybinių požymių lokusai, susiję su atsparumu pietinei antraknozei ir dobilų puviniui

Raudonasis dobilas (Trifolium pratense L.) yra svarbus vidutinio klimato regionų pašarinių ankštinių augalas, ypač vertinamas dėl didelio derlingumo potencialo ir aukštos pašarų kokybės. Nepaisant didelės selekcijos pažangos per pastaruosius dešimtmečius, nuolatinis veislių tobulinimas yra būtinas derlingumo stabilumui užtikrinti, atsižvelgiant į naujai atsirandančias ligas ar besikeičiančias klimato sąlygas. Didelė genetinė įvairovė, būdinga raudonųjų dobilų ekotipams, vietinėms veislėms ir kultivarams, yra neįkainojamas, tačiau dažnai neišnaudojamas išteklius, leidžiantis gerinti pagrindinius požymius, tokius kaip derlingumas, kokybė ir atsparumas biotiniam bei abiotiniam stresui. 397 raudonojo dobilų pavyzdžių kolekcijos genotipai buvo nustatyti naudojant sujungtą genotipavimo sekvenavimo metodą, paimant po 200 augalų iš kiekvieno pavyzdžio. Atsparumas dviem svarbiausioms raudonojo dobilų auginime pasitaikančioms ligoms – pietinei antraknozei, kurią sukelia Colletotrichum trifolii, ir dobilų puviniui, kurį sukelia Sclerotinia trifoliorum, – buvo vertinamas naudojant purškimo inokuliaciją. Vidutinis išgyvenamumas pietinės antraknozės atveju buvo 22,9 %, o vidutinis atsparumo indeksas dobilų puviniui – 34,0 %. Genomo masto asociacijos analizė atskleidė keletą lokusų, kurie yra reikšmingai susiję su atsparumu pietinei antraknozei ir dobilų puviniui. Dauguma šių lokusų yra kodavimo srityse. Vienas kiekybinio požymio lokusas (QTL) 1-oje chromosomoje paaiškino 16,8 % atsparumo pietinei antraknozei variacijos. Dėl atsparumo dobilų puvimui nustatėme aštuonis QTL, kurie kartu paaiškina 80,2 % visos fenotipinės variacijos. Su šiais QTL susiję SNP yra perspektyvus išteklius žymekliais paremtai selekcijai esamose veisimo programose, palengvinantis naujų veislių, pasižyminčių padidintu atsparumu dviem raudonųjų dobilų griaunančioms grybelinėms ligoms, kūrimą.