„POP3 Agricorder Friesland“ galutinė ataskaita: Techninė galutinė ataskaita

Šiame projekte buvo sukurti ir patvirtinti LAMP pagrįsti tyrimai, skirti greitam *Pectobacterium carotovorum* subsp. *brasiliense* ir *Pectobacterium parmentieri* aptikimui bulvių pasėliuose. Pradinių sekų rinkiniai buvo sukurti naudojant BLAST analizę, siekiant užtikrinti specifiškumą, o tyrimų efektyvumas priklausė nuo DNR koncentracijos. Mėginių lizė laboratorijoje sukėlė DNR skilimą transportavimo metu, todėl paaiškėjo, kad siekiant išsaugoti DNR vientisumą, lizę reikia atlikti vietoje. Teigiami kontroliniai mėginiai patvirtino tyrimo funkcionalumą, tačiau kintantys fluorescenciniai signalai parodė sunkumus, susijusius su maža DNR koncentracija arba primerio jautrumu. Mėginių išsaugojimui buvo išbandytas FTA popierius, tačiau rezultatai buvo neaiškūs. Rekomendacijos apima pradinių sekų rinkinių optimizavimą ir patikimų lizės vietoje protokolų parengimą, siekiant pagerinti aptikimo lauke tikslumą.