Mažo tankio avių genotipų rinkinys „SMARTER“ veislėms

SMARTER veislėms buvo sukurtas mažo tankio avių genotipų rinkinys, siekiant sumažinti genotipavimo išlaidas ir kartu išlaikyti aukštą informatyvumą įvairiose populiacijose. Rinkinyje naudojami DNR žymekliai iš įvairių veislių, įskaitant Airijos ir Jungtinės Karalystės mėsines avis bei Prancūzijos pienines avis. Iš viso buvo panaudota 38 883 bendri žymekliai, kad būtų sukurti 384–12 000 žymeklių rinkiniai, atrenkant informatyviausius variantus kiekviename genomo bloke. 1 000 žymenų rinkinys išlieka informatyvus visose veislėse, o 12 000 žymenų rinkinys apima 527 žymenis, kurie nėra informatyvūs bent vienoje veislėje. Visi atrinkti žymenys yra viešai prieinami. Projektą finansuoja Europos Sąjungos programa „Horizontas 2020“ pagal dotacijos susitarimą Nr. 772787.