Fenotipska varijabilnost i kvantitativni lokusi znakova povezani s otpornostlu na južni anthracnose i truljenje korijena kod crvenog krpelja

Crveni koprivnjak (Trifolium pratense L.) je važna krmna leguminoza u umjerenoj kliuci, posebno cijenjena po visokom potencijalu prinosa i visokoj kvaliteti krmne tvari. Iako su tijekom posljednjih desetljeća postignuti značajni napredak u selekciji, stalno unapređenje sorti je nužno kako bi se osigurala stabilnost prinosa uz novootkrivene bolesti ili promjene klimatskih uvjeta. Visoka količina genetske raznolikosti u ekotipovima, starijim sortama i sortama crvenog koprivnjaka pruža neocijenjenu, ali često neiskorištenu priliku za unapređenje ključnih svojstava poput prinosa, kvalitete i otpornosti na biotičke i abiotičke stresne faktore. Kolekcija od 397 pristupa crvenog koprivnjaka bila je genotipirana pomoću kombinirane metode genotipiranja slijedom slijednog otkrivanja s 200 biljaka po pristupu. Otpornost na dvije najvažnije bolesti u proizvodnji crvenog koprivnjaka, južnu antracnozu izazvanu Colletotrichum trifolii i gnilobu koprivnjaka izazvanu Sclerotinia trifoliorum, procijenjena je pomoću sprašivanja. Prosječna stopa preživljavanja pri južnoj antracnozi bila je 22,9 %, a prosječni indeks otpornosti na gnilobu koprivnjaka 34,0 %. Analiza povezanosti na cijelom genomska otkrila je nekoliko lokusa značajno povezanih s otpornostima na južnu antracnozu i gnilobu koprivnjaka. Većina ovih lokusa nalazi se u kodirajućim regijama. Jedan kvantitativni lokus za svojstvo (QTL) na hromosomu 1 objašnjava 16,8 % varijacije otpornosti na južnu antracnozu. Za otpornost na gnilobu koprivnjaka pronađeno je osam QTL, koji zajedno objašnjavaju 80,2 % ukupne fenotipske varijacije. SNP-ovi povezani s ovim QTL-ovima pružaju povoljnu osnovu za selekciju pomoću markera u postojećim programima selekcije, omogućavajući razvoj novih sorti s povećanom otpornošću na dvije razrješne gljivične bolesti crvenog koprivnjaka.