Analiza povezanosti na cijelom genoms unwanted za tolerantnost na sušu i povezane osobine kod fazane (Vicia faba L.)

Španać (Vicia faba L.) je važna leguminoza bogata proteinom prilagođena raznovrsnim klimatskim uvjetima i pruža više koristi za ukupnu održivost gospodarskih sustava. Potražnja za biljnim proteinima raste, a španać je dob将军 kandidat za zadovoljenje te potražnje. Međutim, kultura je vrlo osjetljiva na abiotičke stresne faktore, posebno na sušu, što značajno utječe na prinos i razvoj španca širom svijeta. Stoga je identificiranje gena povezanih s otpornostima na stres zbog suše glavni izazov u selekciji španca. Iako je odziv španca na stres zbog suše široko proučavan, molekularni pristupi za poboljšanje otpornosti na suhu u ovoj kulti ovdje su još uvijek ograničeni. Ovdje smo temeljili na nedavno postignutim genomske napretke, kao što su razvoj prvog visoke gustoće SNP genotipizacijskog niza, kako bismo provedeli studiju povezivanja cijelog genoma (GWAS) koristeći tisuće genetskih polimorfizama kroz cijeli genomska španca. Svjetska kolekcija od 100 pristupa španca bila je uzgajana pod kontrolnim i sušnim uvjetima, a procijenjeno je 10 morfoloških, fizioloških i fenoloških svojstava kako bismo identificirali jedinostupne polimorfizme (SNP) povezane s otpornostima na suhu. Identificirali smo 29 SNP markera značajno povezanih s tim svojstvima pod uvjetima stresa zbog suše. Sekvence uz susedne sekvence bile su uspoređene s referentnim genomima Medicago truncatula radi anotacije potencijalnih kandidatnih gena koji leže iza uzročnih varijacija. Tri od SNP markera za sadržaj klorofila nakon stresa odgovaraju nekarakteriziranim proteinima što ukazuje na prisustvo novih gena povezanih s otpornostima na suhu u špancu. Značaj signalnih prijenosnika induciranih stresom pruža vrijedne informacije o mogućim mehanizmima koji leže u osnovi odziva španca na stres zbog suše, time stvarajući temelj za buduće selekciju pomoću markera u ovoj kulti.