Izračun plastičnosti korenova kod kultivacija za ciljive krmne biljke

Ovaj dokument prikazuje metodologiju kvantificiranja fenotipske plastičnosti korijena pomoću Indeksa plastičnosti relativne udaljenosti (RDP1), što omogućuje selekcionarima ocjenjivanje prilagodljivosti korijenskih svojstava pod stresom okoliša. Dokument detaljno opisuje provedbu RDP1 putem R i RStudio-a, uključujući potrebne pakete — tidyverse, agricolae, psych, Plastcity i ggradar. Vodič sadrži korak po korak upute za pripremu podataka s stupcima za svojstvo, okoliš, genotip i vrijednost svojstva. Funkcija rdp1_matrix izračunava parovima udaljenosti, a RDP1 izračunava se kao prosjek tih udaljenosti s pogreškom standardne pogreške. Formula je izvedena iz relativnih udaljenosti između vrijednosti svojstava. Rezultati se pohranjuju u okvir podataka i vizualiziraju pomoću dijagrama u obliku pаяka (ggradar) i točkastih dijagrama radi usporedbe plastičnosti između genotipova i svojstava. Metoda podržava program u selekciji ciljanih otpornosti na sušu, toplinu ili stres zbog nedostatka nutritivnih tvari, s primjenom i u laboratorijskim i u poljoprivrednim uvjetima.