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Genotipado de 1 444 variedades tradicionales de tomate en el proyecto TRADITOM

El genotipado de 1.444 accesiones de tomate tradicional revela una elevada diversidad genética y datos de SNP fiables para la autenticación y el desarrollo de colecciones de referencia

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Descripción detallada

El proyecto TRADITOM genotipificó 1.444 accesiones de tomate tradicional procedentes de España, Francia, Italia, Grecia e Israel, superando su objetivo inicial de 1.200. Mediante el análisis de SNP, se identificaron 179.000 variantes de alta calidad a partir de un total de 39 millones de SNP. El control de calidad del ADN garantizó que 1.194 muestras superaran los controles iniciales, a las que se añadieron muestras adicionales hasta alcanzar las 1.444 accesiones genotipadas con éxito. El análisis de componentes principales reveló claras distinciones genéticas entre las variedades. El conjunto de datos demuestra una alta variabilidad genética y respalda el desarrollo de una colección principal para el análisis bioquímico en el WP3. El proceso de genotipado demostró ser robusto, y los resultados son adecuados para la autenticación de variedades y la protección de productos tradicionales.

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Información detallada sobre la contribución

Proyecto

TRADITOM

Traditional tomato varieties and cultural practices: a case for agricultural diversification with impact on food security and health of European population

Ubicación
Europe
Autores
Antonio Granell
Propósito
Dissemination

Tipo de fichero
documento
Creado el
01 mar 2016
Lengua materna
English
Web oficial del proyecto
TRADITOM
Licencia
CC BY