Μερικά παραδείγματα πλεονεκτημάτων και περιορισμών της επιλογής με τη βοήθεια μαρκαδόρων στην πατάτα

Η επιλογή με τη βοήθεια δεικτών (SAM) είναι δυνατή μόνο εάν οι μοριακοί δείκτες είναι εύχρηστοι και παρέχουν χρήσιμες πληροφορίες. Στην περίπτωση της πατάτας, ενός τετραπλοειδούς και ετερόζυγου είδους, η SAM δεν έχει ακόμη αναπτυχθεί επαρκώς. Η προσέγγισή μας ήταν, αφενός, να αναζητήσουμε μοριακούς δείκτες που σχετίζονται με χαρακτηριστικά ενδιαφέροντος από διπλοειδείς πληθυσμούς σε διαχωρισμό και να ελέγξουμε τη μεταβιβασιμότητά τους στο τετραπλοειδές επίπεδο και, αφετέρου, να δοκιμάσουμε μοριακούς δείκτες που έχουν ήδη δημοσιευτεί σε διαφορετικά τετραπλοειδή γενετικά αποθέματα. Τα μοντέλα που επιλέχθηκαν ήταν η αντοχή σε βιοεχθρούς (το περονόσπορο των φύλλων που προκαλείται από το Phytophthora infestans, η αντοχή στα κυστοειδή νηματώδη Globodera rostochiensis και G. pallida, η αντοχή στον ιό Y) και η περιεκτικότητα των κονδύλων σε γλυκοαλκαλοειδή. Στην περίπτωση απλού γενετικού ντετερμινισμού (όπως στην περίπτωση του γονιδίου Ry που προσδίδει αντοχή στον ιό Y, το οποίο προέρχεται από το Solanum stoloniferum, ή του γονιδίου R1 αντοχής στο περονόσπορο, το οποίο προέρχεται από το S. demissum), οι δημοσιευμένοι δείκτες επαληθεύτηκαν σε διαφορετικά γενετικά αποθέματα. Όσον αφορά το γονίδιο H1 που προσδίδει ανθεκτικότητα στο G. rostochiensis, ο δείκτης που ήταν διαθέσιμος κατά τη διάρκεια του έργου αποδείχθηκε ότι δεν συνδέεται με την ανθεκτικότητα στο υλικό μας, αλλά έκτοτε έχουν επικυρωθεί άλλοι δείκτες. Στην περίπτωση ολιγογενικής ανθεκτικότητας, όπως η ανθεκτικότητα στο G. pallida, της οποίας ο γενετικός καθορισμός ελέγχεται από 2 QTL, δοκιμάστηκε η μεταφορά 4 δεικτών που επιτρέπουν την παρακολούθηση του QTL ισχυρού αποτελέσματος GpaVspl σε διάφορα τετραπλοειδή γενετικά αποθέματα. Επίσης, επικυρώθηκαν δύο δείκτες που επιτρέπουν την παρακολούθηση του QTL χαμηλής επίδρασης GpaXIspl. Το σύνολο των δεικτών μεταβιβάστηκε στους επαγγελματικούς εταίρους, οι οποίοι πλέον τους χρησιμοποιούν σε διαφορετικές κλίμακες στα προγράμματα επιλογής τους. Όσον αφορά τα χαρακτηριστικά πολυγονιδιακού καθορισμού (αντοχή στον περονόσπορο του φυλλώματος και περιεκτικότητα σε γλυκοαλκαλοειδή), φαίνεται προς το παρόν πρόωρο να εξεταστεί η εφαρμογή της SAM.