γενετικός έλεγχος της ανθεκτικότητας στην ανθρακνόζη του νότου στο κόκκινο τριφύλλι

Δείγματα κόκκινου τριφυλλιού (Trifolium pratense L.) από 28 χώρες αξιολογήθηκαν ως προς την ανθεκτικότητά τους στην νότια ανθρακνόζη που προκαλείται από το Colletotrichum trifolii. Οι δοκιμές σε θερμοκήπιο με εμβολιασμό μεμονωμένων σπορίων έδειξαν μέσο ποσοστό επιβίωσης 23%, με μόνο 10 δείγματα να ταξινομούνται ως ανθεκτικά. Η γονότυπηση μέσω αλληλούχισης απέδωσε 30.668 SNP, εκ των οποίων τα 12.272 χρησιμοποιήθηκαν στην ανάλυση. Οι εκτιμήσεις BLUP και η ανάλυση GWAS με τη μέθοδο FarmCPU εντόπισαν πάνω από δέκα SNP που συσχετίζονται σημαντικά με την ανθεκτικότητα. Η ανάλυση κύριων συνιστωσών αποκάλυψε τη γενετική δομή μεταξύ των δειγμάτων. Τα αποτελέσματα αυτά υποστηρίζουν τη γενετική βελτίωση με τη βοήθεια δεικτών για τη δημιουργία διαρκούς ανθεκτικότητας, ιδίως υπό τις συνθήκες της κλιματικής αλλαγής. Με την υποστήριξη του προγράμματος EUCLeg του προγράμματος H2020 της ΕΕ.