Υπολογισμός της πραγματοποιηθείσας αξιοπιστίας με τη χρήση γραμμικής παλινδρόμησης στις γενετικές αξιολογήσεις

Το παρόν έγγραφο περιγράφει λεπτομερώς τη χρήση της γραμμικής παλινδρόμησης (LR) για την εκτίμηση της ακρίβειας των γονιδιωματικών προβλέψεων στην κτηνοτροφία, συγκεκριμένα στο πλαίσιο του προγράμματος SMARTER (χρηματοδότηση ΕΕ «Ορίζοντας 2020», αριθ. 772787). Εξηγεί τον τρόπο υπολογισμού της πραγματοποιηθείσας αξιοπιστίας μέσω της συσχέτισης των «παλαιών» γενετικών αξιολογήσεων κατά τη γέννηση με τις «πιο πρόσφατες» αξιολογήσεις, αφού καταστούν διαθέσιμα πρόσθετα δεδομένα (π.χ. αρχεία απογόνων). Η μέθοδος ποσοτικοποιεί τη σχετική αύξηση της ακρίβειας από τη γέννηση έως την ωριμότητα χρησιμοποιώντας τον τύπο [1/r(w,p)] - 1, όπου r(w,p) είναι η συσχέτιση μεταξύ παλαιών και πρόσφατων αποδείξεων. Ένα r(w,p) 0,8, για παράδειγμα, υποδηλώνει αύξηση της ακρίβειας κατά 25%. Οι υψηλές τιμές r(w,p) υποδηλώνουν αξιόπιστες πρώιμες προβλέψεις, ενώ οι χαμηλές τιμές υποδηλώνουν αναξιοπιστία. Για έγκυρα αποτελέσματα απαιτείται ελάχιστος αριθμός 50 ζώων. Τα ευρήματα υποστηρίζουν τη βελτίωση των αποφάσεων αναπαραγωγής στα μικρά μηρυκαστικά.