Karte zur geografischen Verbreitung der CaLsol-Haplotypen in Europa

„Candidatus Liberibacter solanacearum“ (Lso) wurde in mehreren wichtigen Kulturpflanzen aus den Familien der Solanaceae (Kartoffel, Tomate, Paprika und Tabak) in Amerika und Neuseeland sowie der Apiaceae (Karotte, Sellerie, Petersilie und Pastinake) in Europa nachgewiesen. Eine phylogenetische Analyse unter Verwendung einer Kombination aus den Gensequenzen der 16S rRNA, der intergenen Spacer-Region (ISR) zwischen 16S und 23S rRNA sowie des 50S-Ribosomproteins ergab, dass die in verschiedenen geografischen Regionen gefundenen Lso-Bakterien vielfältig waren und fünf separaten Kladen zugeordnet werden konnten: Haplotyp A, B, C, D oder E (Nelson et al., 2011; Teresani et al., 2014). Die Lso-Haplotypen A und B, die mit der Zebra-Chip-Krankheit bei Kartoffeln assoziiert sind (Secor et al., 2009) und durch die Blattflöhe Bactericera cockerelli übertragen werden, kommen in Europa nicht vor. Der Lso-Haplotyp C (LsoC) mit der Karottenvergilbungskrankheit in Nordeuropa in Verbindung gebracht, wo er durch die Karottenblattfliege Trioza apicalis übertragen wird und aufgrund der kombinierten Auswirkungen der bakteriellen Infektionen und der Fraßschäden der Blattfliege zu schweren Ertragsverlusten bei Karotten führt (Munyaneza et al., 2010; Munyaneza et al., 2011; Nissinen et al., 2014). Es wurde auch berichtet, dass LsoC Karotten in Schweden, Norwegen und Deutschland befällt (Munyaneza et al., 2010, Munyaneza et al., 2012a; Munyaneza et al., 2012b). In Südeuropa wurde berichtet, dass die Lso-Haplotypen D und E (LsoD bzw. LsoE) Karotten, Sellerie, Pastinaken und Petersilie befallen und durch die Blattflöhe Bactericera trigonica übertragen werden (Alfaro-Fernandez et al., 2012; Nelson et al., 2013; Teresani et al., 2014; Alfaro-Fernandez et al., 2017; Antolinez et al., 2017). Obwohl Lso in Frankreich nachgewiesen wurde, müssen die Charakterisierung der Haplotypen und ihre Verbreitung noch ermittelt werden. Das Hauptziel dieser Studie, die im Rahmen der Aufgabe 3b des Projekts durchgeführt wurde, bestand daher darin, das Wissen über die Verbreitung von Lso- Haplotypen in Europa zu erweitern.