Фенотипна вариация и локуси на количествени признаци за устойчивост към южна антракноза и гниене на червената детелина

Червената детелина (Trifolium pratense L.) е важно фуражно бобово растение в умерените климатични зони, което се цени особено заради високия си добив и високото качество на фуража. Въпреки значителния напредък в селекцията през последните десетилетия, непрекъснатото подобряване на сортовете е от решаващо значение за осигуряване на стабилност на добива с оглед на новопоявилите се болести или променящите се климатични условия. Голямото генетично разнообразие, присъщо на екотиповете, местните сортове и култиварите на червената детелина, представлява безценен, но често неизползван ресурс за подобряване на ключови характеристики като добив, качество и устойчивост към биотичен и абиотичен стрес. Колекция от 397 доступа на червена детелина беше генотипизирана чрез подход на обединено генотипизиране чрез секвениране с по 200 растения на достъп. Устойчивостта към двете най-значими болести в производството на червена детелина – южната антракноза, причинена от Colletotrichum trifolii, и гниенето на детелината, причинено от Sclerotinia trifoliorum, беше оценена чрез инокулация чрез пръскане. Средният процент на оцеляване при южната антракноза беше 22,9%, а средният индекс на устойчивост при гниенето на детелината – 34,0%. Анализът на асоциациите в целия геном разкри няколко локуса, значително свързани с устойчивостта към южната антракноза и гниенето на детелината. Повечето от тези локуси се намират в кодиращи региони. Един локус на количествен белег (QTL) на хромозома 1 обяснява 16,8% от вариацията в резистентността към южната антракноза. За устойчивостта към гниене на детелината открихме осем QTL, които заедно обясняват 80,2% от общата фенотипна вариация. SNP-те, свързани с тези QTL, представляват обещаващ ресурс за селекция, подпомагана от маркери, в съществуващите селекционни програми, като улесняват разработването на нови сортове с повишена устойчивост срещу две опустошителни гъбични болести по червената детелина.