Изчисляване на фенотипната пластичност на корените при селекцията на култури

В настоящия документ се представя метод за количествено определяне на фенотипната пластичност на корените чрез използване на индекса за относителна дистанционна пластичност (RDP1), който позволява на селекционерите да оценят адаптивността на кореновите характеристики при стрес, предизвикан от околната среда. В него подробно се описва прилагането на RDP1 чрез R и RStudio, включително необходимите пакети — tidyverse, agricolae, psych, Plastcity и ggradar. Ръководството предоставя стъпка по стъпка инструкции за подготовка на данни с колони за характеристика, среда, генотип и стойност на характеристиката. Функцията rdp1_matrix изчислява разстоянията между двойките, а RDP1 се изчислява като средната стойност на тези разстояния със стандартна грешка. Формулата се извежда от относителните разстояния между стойностите на характеристиките. Резултатите се съхраняват в матрица от данни и се визуализират с помощта на паякови диаграми (ggradar) и точкови диаграми, за да се сравни пластичността между генотипите и характеристиките. Методът подкрепя селекционни програми, насочени към устойчивост на суша, топлина или стрес от недостиг на хранителни вещества, с приложения както в лабораторни, така и в полеви условия.