Карта на географското разпространение на хаплотиповете CaLsol в Европа

„Candidatus Liberibacter solanacearum“ (Lso) е открит в няколко важни култивирани растения от семейства Solanaceae (картофи, домати, сладки пиперки и тютюн) в Америка и Нова Зеландия, както и от семейство Apiaceae (моркови, целина, магданоз и пащърнак) в Европа. Филогенетичният анализ, използващ комбинация от 16S рРНК, междугенния спейсер (ISR) на 16S-23S рРНК и геновите последователности на 50S рибозомния протеин, разкри, че бактериите Lso, открити в различни географски региони, са разнообразни и могат да бъдат отнесени към пет отделни клади: хаплотип A, B, C, D или E (Nelson et al., 2011; Teresani et al., 2014). Хаплотипите на Lso A и B, свързани с болестта „Zebra chip“ по картофите (Secor et al., 2009) и пренасяни от псилидата Bactericera cockerelli, не се срещат в Европа. Докато хаплотип C на Lso (LsoC) е свързан с болестта по пожълтяване на морковите в Северна Европа, където се предава от морковната псилида Trioza apicalis, причинявайки тежки загуби на добив при морковите поради съпътстващите ефекти от бактериалните инфекции и уврежданията от храненето на псилидите (Munyaneza et al., 2010; Munyaneza et al., 2011; Nissinen et al., 2014). Съобщава се също, че LsoC заразява моркови в Швеция, Норвегия и Германия (Munyaneza et al., 2010, Munyaneza et al., 2012a; Munyaneza et al., 2012b). В Южна Европа е съобщено, че хаплотипове D и E на Lso (LsoD и LsoE, съответно) заразяват моркови, целина, пащърнак и магданоз и се предават от псилидата Bactericera trigonica (Alfaro-Fernandez et al., 2012; Nelson et al., 2013; Teresani et al., 2014; Alfaro-Fernandez et al., 2017; Antolinez et al., 2017). Въпреки че Lso е открит във Франция, характеристиката на хаплотиповете и тяхното разпространение все още не са установени. Поради това основната цел на настоящото проучване, разработено в рамките на задача 3б от проекта, беше да се подобри познанието за разпространението на Lso хаплотиповете в Европа.